Lapidariul medieval și premodern este cea mai mare colecție de acest gen din țară, compusă din monumente funerare, arhitectonice și sculpturale din secolele XIII-XIX, provenite din achiziţii, donaţii, demolări şi din săpături arheologice sistematice sau de salvare.
Formarea lapidariului este în strânsă legătură cu activitatea Societății Muzeului Ardelean, precursorul muzeului actual, care începând din jumătatea a doua a secolului al XIX-lea a inițiat strângerea sistematică a elementelor arhitectonice provenite din demolările monumentelor transilvănene, cu preponderență din centrul istoric al orașului Cluj.
Colecția lapidariului medieval și premodern este compusă din monumente arhitectonice romanice, gotice și renascentiste, din monumente sculpturale baroce, dintr-o colecție vastă de monumente funerare renascentiste și din colecția copiilor în ghips a diferitelor tipuri de monumente funerare și sculpturale medievale din Transilvania.
Cea mai semnificativă parte a colecției este alcătuită din monumentele arhitectonice provenite din casele de locuit ale Clujului Renașterii, printre care regăsim ancadramente de portaluri și de ferestre, șeminee, o serie de console, baluștri și chei de boltă, unele marcate cu blazoanele sau cu monogramele proprietarilor acestora.